• IDENTIFICATION
  • CARTOGRAPHIE DES SITES
  • RÉCUPÉRATION
  • RÉVISION HUMAINE

Annoter des domaines protéiques avec votre IA

Connectez votre IA à InterPro pour extraire les données de domaines et de familles directement depuis vos séquences protéiques. Votre agent gère les recherches en base de données pendant que vous vous concentrez sur l'analyse biologique.

Demandez à l'IA à propos de cette page

Réponse rapide

Comment utiliser l'IA pour annoter des domaines protéiques ?

Votre IA interroge la base de données InterPro pour faire correspondre vos séquences à des familles, domaines et sites fonctionnels spécifiques. Vous obtenez des annotations structurées et l'identification de sites fonctionnels sans recherche manuelle. Ce processus lie vos séquences à des signatures biologiques connues.

Résultats d'annotation

Ce que produit votre IA

Les données précises que votre agent extrait d'InterPro.

IDENTIFICATION

Cartographie des familles et domaines

L'IA identifie les familles de protéines et les domaines structuraux. Vous recevez une liste claire des classifications biologiques pour vos données.

CARTOGRAPHIE DES SITES

Détection de sites fonctionnels

Votre agent repère les sites fonctionnels au sein de la séquence, mettant en évidence les sites actifs ou les régions de liaison identifiés par InterPro.

RÉCUPÉRATION

Détails des entrées protéiques

L'IA extrait les détails complets des entrées pour des protéines spécifiques, vous fournissant le contexte nécessaire pour comprendre leur rôle.

RÉVISION HUMAINE

Validation requise

L'IA fournit les annotations brutes de la base de données. Vous devez vérifier ces résultats selon votre contexte expérimental spécifique.

Le flux

Ce que fait votre IA dès réception d'une séquence.

L'IA transforme une séquence brute en un profil fonctionnel complet grâce aux outils InterPro.

  1. Recherche d'entrées

    L'IA parcourt la base de données InterPro pour trouver les entrées protéiques pertinentes selon votre séquence ou vos identifiants.

    search_entries

  2. Récupération des données

    Une fois la correspondance trouvée, l'IA extrait la fiche protéique pour accéder à l'intégralité de son profil de domaines.

    get_protein

  3. Extraction de listes

    L'IA rassemble une liste de toutes les entrées protéiques liées pour garantir une annotation exhaustive.

    get_protein_entries

  4. Synthèse des annotations

    L'IA compile les informations sur les domaines, familles et sites en un résumé lisible pour votre analyse.

    get_protein

Essayez

Copiez ces commandes pour commencer.

Utilisez ces prompts pour lancer votre tâche d'annotation.

Points de départ

Remplacez le texte entre crochets par vos numéros d'accession ou vos séquences réelles.

InterPro Connector

Tout est prêt. Choisissez votre client MCP et suivez les instructions de configuration.

Lien du connecteurhttps://edge.vinkius.com/vk_preview_cBrAY2Gy2NSFguudqzcAnkyhKLGxzkfF44ThKH5h/mcp

Claude Desktop

Suivez les étapes ci-dessous pour vous connecter en quelques secondes.

  1. 1In Claude Desktop, open Settings → Connectors.
  2. 2Click “Add custom connector” and paste the connector link above as the remote MCP server URL.
  3. 3Click Add and start a new chat — InterPro capabilities are ready to use.
Configuration · claude_desktop_config.jsonCopier
{
  "mcpServers": {
    "ebi-interpro-mcp": {
      "url": "https://edge.vinkius.com/vk_preview_cBrAY2Gy2NSFguudqzcAnkyhKLGxzkfF44ThKH5h/mcp"
    }
  }
}
Copiez dans le chat04

  • Cherche dans InterPro l'entrée protéique avec l'accession P12345 et liste ses domaines fonctionnels.

  • Identifie les familles de protéines associées à cette séquence : [insérer la séquence].

  • Donne les détails des sites fonctionnels pour l'entrée protéique UniProt ID Q9H4A4.

  • Trouve toutes les entrées protéiques liées au domaine 'Zinc finger' en utilisant InterPro.

  • Claude
  • ChatGPT
  • Cursor
  • VS Code
  • Windsurf
  • Claude Code
  • JetBrains
  • Cline

Commencez ici

Connectez EBI InterPro une fois, puis interrogez.

Une seule connexion donne à votre IA l'accès à l'ensemble de la base InterPro. Vos identifiants restent chiffrés et sécurisés.

Connecter EBI InterPro à votre IA

FAQ

Fonctionnement de l'annotation

  • 01

    L'IA peut-elle prédire de nouveaux domaines absents d'InterPro ?

    Non. L'IA se contente de récupérer et de rapporter les annotations existantes présentes dans la base InterPro.

  • 02

    L'IA peut-elle modifier les enregistrements dans la base de données ?

    Non. L'IA peut uniquement lire et interroger les données ; elle ne peut ni modifier ni supprimer d'entrées dans InterPro.

  • 03

    L'IA fournit-elle des modèles structuraux ?

    Non. Elle fournit des annotations de domaines fonctionnels et de familles basées sur les entrées de la base de données.

  • 04

    Puis-je utiliser cela pour des recherches de séquences personnalisées ?

    Oui. Vous pouvez fournir une séquence à l'IA pour trouver des entrées correspondantes dans la base de données.

  • 05

    L'IA enregistrera-t-elle automatiquement ces annotations dans mes fichiers ?

    Non. L'IA fournit les informations dans le chat. Vous devez enregistrer ou exporter les résultats manuellement.

  • D'autres questions sur EBI InterPro ? La page du connecteur y répond. Voir toutes les capacités du connecteur EBI InterPro

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