AIを活用してタンパク質の機能ドメインを注釈化する方法

AIがInterProデータベースに照会し、タンパク質配列を特定のファミリー、ドメイン、機能部位にマッピングします。手動でデータベースを検索することなく、構造化された注釈や機能部位の特定結果を得られます。このプロセスにより、配列を既知の生物学的シグネチャーに紐付けることが可能です。

1. 01

   エントリの検索

   AIがInterProデータベースを検索し、入力された配列や識別子に基づいて関連するタンパク質エントリを見つけます。

   search_entries
2. 02

   タンパク質データの取得

   一致するデータが見つかると、AIはそのタンパク質の詳細なドメインプロファイルにアクセスするために、特定のレコードを取得します。

   get_protein
3. 03

   エントリリストの収集

   注釈化を網羅的なものにするため、AIは関連するすべてのタンパク質エントリのリストを収集します。

   get_protein_entries
4. 04

   注釈の統合

   AIはドメイン、ファミリー、部位の情報をまとめ、解析しやすい要約を作成します。

   get_protein

InterPro Connector

準備完了です。MCPクライアントを選択し、セットアップ手順に従ってください。

コネクタリンクhttps://edge.vinkius.com/vk_preview_cBrAY2Gy2NSFguudqzcAnkyhKLGxzkfF44ThKH5h/mcpコピー

Claude Desktop

以下の手順で数秒で接続できます。

1. 1In Claude Desktop, open Settings → Connectors.
2. 2Click “Add custom connector” and paste the connector link above as the remote MCP server URL.
3. 3Click Add and start a new chat — InterPro capabilities are ready to use.

設定 · claude_desktop_config.jsonコピー

{
  "mcpServers": {
    "ebi-interpro-mcp": {
      "url": "https://edge.vinkius.com/vk_preview_cBrAY2Gy2NSFguudqzcAnkyhKLGxzkfF44ThKH5h/mcp"
    }
  }
}

• Claude
• ChatGPT
• Cursor
• VS Code
• Windsurf
• Claude Code
• JetBrains
• Cline

一度接続するだけで、AIがInterProデータベース全体にアクセスできるようになります。認証情報は暗号化され、安全に保持されます。

• 01

  AIはInterProに存在しない新しいドメインを予測できますか？

  いいえ。AIはInterProデータベース内に存在する既存の注釈を取得し、報告することのみが可能です。

• 02

  AIはデータベース内のタンパク質レコードを書き換えることができますか？

  いいえ。AIはデータの読み取りと照会のみを行うことができます。InterPro内のエントリを変更または削除することはできません。

• 03

  AIは構造モデルを提供しますか？

  いいえ。データベースのエントリに基づいた、機能ドメインおよびファミリーの注釈を提供します。

• 04

  カスタム配列の検索に使用できますか？

  はい。配列をAIに提供することで、データベース内の合致するエントリを検索できます。

• 05

  AIはこれらの注釈を自動的にファイルに保存しますか？

  いいえ。AIはチャット上で情報を提供します。結果を保存またはエクスポートするには、手動で行う必要があります。

• EBI InterProに関するその他の質問は、Connectorのページで確認できます。 EBI InterPro Connectorの全機能を見る