AIを使って生物学的配列を検索する方法：GenBank/NCBI API連携

探している配列や生物の名前を、普段使っている言葉でAIに伝えるだけです。AIがGenBank/NCBI APIを使用して、必要なヌクレオチドやタンパク質のデータを特定し、取得します。チャット画面に、生の配列データやデータベースの識別子が直接表示されます。

1. 01

   対象の特定

   AIがリクエストを解析し、特定のタンパク質、ヌクレオチド、または利用可能なデータベース一覧のどれを探しているのかを判断します。

   list_ncbi_databases
2. 02

   検索の実行

   エージェントがあなたの説明を、正しいNCBIレコードを対象としたクエリに変換します。

   search_ncbi_sequences
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   データの取得

   AIが検索条件に関連する特定の遺伝子配列やメタデータを取得します。

   search_ncbi_sequences
4. 04

   結果の提示

   エージェントが配列データやデータベース情報を、チャット画面で読みやすい形式に整えて表示します。

   search_ncbi_sequenceslist_ncbi_databases

GenBank/NCBI Connector

準備完了です。MCPクライアントを選択し、セットアップ手順に従ってください。

コネクタリンクhttps://edge.vinkius.com/vk_preview_0wuiFY9KFNe14e8WQok4IyjNxTHA4yJHIB6E1Y2E/mcpコピー

Claude Desktop

以下の手順で数秒で接続できます。

1. 1In Claude Desktop, open Settings → Connectors.
2. 2Click “Add custom connector” and paste the connector link above as the remote MCP server URL.
3. 3Click Add and start a new chat — GenBank/NCBI capabilities are ready to use.

設定 · claude_desktop_config.jsonコピー

{
  "mcpServers": {
    "genbankncbi-api-mcp": {
      "url": "https://edge.vinkius.com/vk_preview_0wuiFY9KFNe14e8WQok4IyjNxTHA4yJHIB6E1Y2E/mcp"
    }
  }
}

• Claude
• ChatGPT
• Cursor
• VS Code
• Windsurf
• Claude Code
• JetBrains
• Cline

クリック一つで、このMCPをクライアントに接続できます。認証情報は暗号化されて安全に保持され、すぐにNCBIへのクエリを開始できます。

• 01

  AIはGenBank内の配列を編集できますか？

  いいえ。AIができるのは既存の配列の検索と取得のみです。NCBIのデータを変更したり、アップロードしたりすることはできません。

• 02

  名前の一部だけで配列を検索できますか？

  はい。AIは検索ツールを使用して、提供された名前や識別子に基づいた最適な一致結果を探します。

• 03

  AIが実際の配列アライメント（整列）を行うことはありますか？

  いいえ。AIは配列を取得する役割を担います。アライメントを行うには、ご自身のツールを使用するか、取得したデータに対してAIに解析を依頼してください。

• 04

  NCBI以外のデータベースの配列も検索できますか？

  いいえ。このMCPは、NCBIおよびGenBankデータベースとの連携専用に構築されています。

• 05

  取得した配列はローカルファイルに保存されますか？

  いいえ。AIはチャット内でデータを提供します。後で利用するために配列を保存したい場合は、ユーザー自身で保存を行う必要があります。

• GenBank/NCBI APIについてさらに詳しく知りたいですか？ GenBank/NCBI API Connectorの全機能を見る