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AIを活用して生物学的識別子を変換する方法:KEGG Connector

KEGGをAIクライアントに一度接続するだけで、簡単なコマンドを使ってデータベース間で識別子を相互変換できるようになります。

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すぐに答え

KEGG IDを他の形式に変換するには?

AIがKEGG Connectorを使用し、KEGGの識別子をUniProtやNCBIの形式に変換します。手動で照合することなく、異なる生物学的データセットを統合できます。変換後は、マッピングされたIDのクリーンなリストが得られます。

出力結果

データの活用先

AIがマッピングを行うため、整理された使いやすい識別子のみが手元に残ります。

マッピング済み

統合されたIDリスト

AIがKEGGのエントリをUniProtやNCBIの識別子に変換します。他のデータセットと一致する、整理されたIDセットが得られます。

検証済み

クロスリファレンス済みデータ

エージェントがKEGGデータベースと照合を行います。これにより、受け取る識別子の正確性が保証されます。

エクスポート済み

解析準備完了

AIは出力をリストやテーブル形式で出力できます。そのままスプレッドシートやスクリプトに直接取り込めます。

レビュー

人間による確認

一致するデータが見つからない識別子がある場合、AIがフラグを立てます。それらのデータの扱いについては、ユーザーが判断できます。

ワークフロー

リクエストを受けた際のAIの動作

AIはKEGGと他の生物学的データソースを繋ぐ架け橋となります。

  1. IDの特定

    AIが提供されたリストをスキャンし、変換が必要な特定のKEGG識別子を抽出します。

    kegg_conv
  2. 識別子のマッピング

    エージェントがKEGGからターゲットとなるデータベース形式への実際の変換を実行します。

    kegg_conv
  3. 一致の検証

    AIが新しい識別子をターゲットデータベースと照合し、存在を確認します。

    kegg_conv
  4. 出力の整形

    エージェントが変換したIDを、ワークフローに合わせて指定された構造に整理します。

    kegg_conv

試してみる

以下のプロンプトをコピーして開始

これらのプロンプトを使って変換プロセスを開始できます。

出発点

括弧内のテキストを、実際のデータや特定のデータベース名に置き換えてください。

KEGG Connector

準備完了です。MCPクライアントを選択し、セットアップ手順に従ってください。

コネクタリンクhttps://edge.vinkius.com/vk_preview_3VQS6ta0LfpPfSufEA9QzNKVt9adBMSWJpS3FFGz/mcp

Claude Desktop

以下の手順で数秒で接続できます。

  1. 1In Claude Desktop, open Settings → Connectors.
  2. 2Click “Add custom connector” and paste the connector link above as the remote MCP server URL.
  3. 3Click Add and start a new chat — KEGG capabilities are ready to use.
設定 · claude_desktop_config.jsonコピー
{
  "mcpServers": {
    "kegg-mcp": {
      "url": "https://edge.vinkius.com/vk_preview_3VQS6ta0LfpPfSufEA9QzNKVt9adBMSWJpS3FFGz/mcp"
    }
  }
}
チャットにコピー04
  • これらのKEGG IDをUniProtのアクセッション番号に変換してください: [ここにIDを貼り付け]

  • このKEGG識別子のリストをNCBI Gene IDにマッピングしてください: [ここにIDを貼り付け]

  • スプレッドシートにあるKEGG IDを取得し、対応するUniProtのエントリを見つけてください。

  • これらのKEGG IDに有効なNCBIのマッピングがあるか確認し、存在しないものをリストアップしてください。

  • Claude
  • ChatGPT
  • Cursor
  • VS Code
  • Windsurf
  • Claude Code
  • JetBrains
  • Cline

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KEGGを一度接続すれば、あとは指示するだけ

KEGG MCPをクライアントにリンクさせるだけです。認証情報は暗号化されて保護されるため、すぐにIDの変換を開始できます。

KEGGをAIに接続する

FAQ

動作に関する詳細

  • 01

    AIはどんなデータベースにもIDを変換できますか?

    いいえ。KEGGのマッピングツールがサポートしている標準的な生物学的データベースに限定されます。

  • 02

    AIは元のKEGGデータを書き換えてしまいますか?

    いいえ。AIは識別子を読み取って新しいマッピング済みIDリストを作成するだけです。元のファイルが変更されることはありません。

  • 03

    KEGG IDに一致するものがない場合はどうなりますか?

    AIはその特定のIDに対してマッピングが見つからなかったことを報告します。一致しないものを推測したり、捏造したりすることはありません。

  • 04

    変換のためにCSVファイルを丸ごとアップロードできますか?

    はい。お使いのAIクライアントがファイルアップロードに対応していれば、ファイルを提示してその中のIDを処理するよう指示できます。

  • 05

    AIがデータのクリーニングも行ってくれますか?

    AIは処理の過程で、識別子から空白や余分な文字を取り除くことができます。ただし、最終的なリストは必ずユーザー自身で確認してください。

  • KEGGに関するその他の質問 KEGG Connectorの全機能を見る

『KEGG』を Claude、Cursor、ChatGPT などに接続