AIでPubChemの化合物識別子（CID）を検索する方法

AIがPubChem PUG REST APIを呼び出し、入力されたテキストをPubChemデータベースと照合します。これにより、研究に必要な正確な化合物識別子（CID）が返されます。特定のIDと一致する名称がすぐに表示されます。

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   クエリの解析

   AIが自然言語によるリクエストを解釈し、検索したい化学名やキーワードを抽出します。

   search_compound_cids
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   APIの実行

   解析された名称をPubChem PUG RESTサービスへ送信し、一致するエントリを探します。

   search_compound_cids
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   結果のフィルタリング

   返されたデータの中から、最も関連性の高い化合物識別子をAIが選別します。

   search_compound_cids
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   データの提供

   抽出されたCIDと関連名称を、チャット画面上に整理された形式で表示します。

   search_compound_cids

PubChem Connector

準備完了です。MCPクライアントを選択し、セットアップ手順に従ってください。

コネクタリンクhttps://edge.vinkius.com/vk_preview_39PvvjDIh0Gw5sIiVCJqmFBNo6SJy2fu1ixaSd7V/mcpコピー

Claude Desktop

以下の手順で数秒で接続できます。

1. 1In Claude Desktop, open Settings → Connectors.
2. 2Click “Add custom connector” and paste the connector link above as the remote MCP server URL.
3. 3Click Add and start a new chat — PubChem capabilities are ready to use.

設定 · claude_desktop_config.jsonコピー

{
  "mcpServers": {
    "pubchem-pug-rest-api-mcp": {
      "url": "https://edge.vinkius.com/vk_preview_39PvvjDIh0Gw5sIiVCJqmFBNo6SJy2fu1ixaSd7V/mcp"
    }
  }
}

• Claude
• ChatGPT
• Cursor
• VS Code
• Windsurf
• Claude Code
• JetBrains
• Cline

ワンクリックでMCPをクライアントに接続できます。認証情報は当社のシステム内で暗号化され、安全に管理されます。

• 01

  AIは化合物の分子量を調べることができますか？

  いいえ。このツールは、名称やキーワードに基づいて化合物識別子（CID）を見つけるための専用ツールです。

• 02

  AIはPubChemのデータベースを更新できますか？

  いいえ。AIはPubChemからデータを読み取ることはできますが、化学レコードの追加、編集、削除を行うことはできません。

• 03

  化学名の綴りを間違えた場合はどうなりますか？

  AIはPubChem内で最も近い一致を試みますが、得られたCIDが正しいかどうかは必ずご自身で確認してください。

• 04

  SMILES文字列を使用して検索できますか？

  いいえ。このツールは、名称やキーワードを用いてCIDを取得するように設計されています。

• 05

  どのCIDが最も生物学的に活性が高いか、AIが提案してくれることはありますか？

  いいえ。AIは識別子を取得するだけであり、生物学的または薬理学的な分析は行いません。

• PubChem PUG REST APIについて他に質問がありますか？コネクタの専用ページで回答しています。 PubChem PUG REST API Connectorの全機能を見る