AIでPubChemから分子のメタデータを取得する方法

AIにPubChemの化合物ID（CID）を伝えると、PUG REST APIを使用して特定の分子特性を取得します。分子量や化学式などの技術データが得られます。以下の手順で、セットアップから活用方法までを確認できます。

1. 01

   対象の特定

   AIがリクエストを解析し、照会したい特定の化合物IDを特定します。

   get_compound_by_cid
2. 02

   データの取得

   エージェントがAPIを呼び出し、そのIDに関連付けられた技術的なメタデータを取得します。

   get_compound_by_cid
3. 03

   結果の整形

   AIが取得したJSONレスポンスを、読みやすい要約や構造化されたリストに変換します。

   get_compound_by_cid
4. 04

   質問への回答

   取得した特定の特性について、続けてAIに質問することができます。

   get_compound_by_cid

PubChem Connector

準備完了です。MCPクライアントを選択し、セットアップ手順に従ってください。

コネクタリンクhttps://edge.vinkius.com/vk_preview_39PvvjDIh0Gw5sIiVCJqmFBNo6SJy2fu1ixaSd7V/mcpコピー

Claude Desktop

以下の手順で数秒で接続できます。

1. 1In Claude Desktop, open Settings → Connectors.
2. 2Click “Add custom connector” and paste the connector link above as the remote MCP server URL.
3. 3Click Add and start a new chat — PubChem capabilities are ready to use.

設定 · claude_desktop_config.jsonコピー

{
  "mcpServers": {
    "pubchem-pug-rest-api-mcp": {
      "url": "https://edge.vinkius.com/vk_preview_39PvvjDIh0Gw5sIiVCJqmFBNo6SJy2fu1ixaSd7V/mcp"
    }
  }
}

• Claude
• ChatGPT
• Cursor
• VS Code
• Windsurf
• Claude Code
• JetBrains
• Cline

ボタンをクリックして、MCPをクライアントにリンクさせてください。認証情報は暗号化され、すぐにPubChemへのクエリが可能になります。

• 01

  AIはCIDではなく、名前で化学物質を検索できますか？

  いいえ。このツールでデータを取得するには、一意の化合物ID（CID）が必要です。

• 02

  AIはPubChemデータベースの情報を更新できますか？

  いいえ。AIはPubChemからデータを読み取ることはできますが、レコードの変更や追加はできません。

• 03

  AIは構造図を提供してくれますか？

  いいえ。このツールが取得するのは技術的なメタデータとテキストベースの特性であり、画像ファイルではありません。

• 04

  Claudeで使用できますか？

  はい。Claude DesktopなどのMCP対応クライアントを使用していれば可能です。

• 05

  無効なCIDを指定した場合はどうなりますか？

  AIはその特定のIDに一致する化合物が見つからない旨を報告します。

• PubChem PUG REST APIについて他に質問がありますか？コネクタのページで回答しています。 PubChem PUG REST API Connectorの全機能を見る