An astronaut overseeing a futuristic data hub
Baixar PDFVersão em Markdown

Conecte Ensembl ao ChatGPT, Claude e Gemini

Configure uma vez e funcione no ChatGPT, Claude, Cursor e em qualquer outro cliente que você goste. Tudo roda com segurança em segundo plano, para você relaxar e focar no que realmente importa. Conecte sua IA ao banco de dados Ensembl para análises biológicas avançadas.

Pergunte à IA sobre este Connector

Desenvolvido, mantido e hospedado pela Vinkius.

MCP VERIFICADO · PRONTO PARA PRODUÇÃO · GARANTIA VINKIUS

Waiting for input…

Works with modern AI clients that support MCP, including ChatGPT, Claude, Cursor, and more.

ChatGPTClaudeCursorPerplexityGeminiMicrosoft CopilotRaycastMeta AI

A sua IA faz o trabalho. A gente cuida com segurança.

Nenhuma outra ferramenta de IA te dá isso. O seu workflow roda no cliente que você já ama, a sua conta fica protegida, e você decide o que o agente pode e não pode fazer. É a razão completa para mudar de vez.

Cada Connector vive dentro da nossa infraestrutura, no mesmo lugar onde o seu workflow roda. As três coisas abaixo já fazem parte dele, trabalhando silenciosamente em segundo plano para que você nunca precise pensar nelas. Nada para adicionar, nada para configurar, nada com que se preocupar.

A futuristic MCP client docking bay
V8 Isolate01

Cada Connector roda dentro do seu próprio ambiente lacrado.

Cada Connector roda em seu próprio runtime V8 lacrado — sem acesso aos seus arquivos, ao seu sistema ou a outros servidores. Um Connector nunca enxerga além da sua própria requisição.

Kill Switch02

Um interruptor para todos os agentes. Na hora.

Uma única ação desativa todos os Connectors, revoga todos os tokens e encerra todas as sessões de uma vez. A Governança de IA guarda o registro.

FinOps por usuário03

Limites de gastos que pausam em vez de assustar.

Cada usuário tem suas próprias conexões e credenciais, isoladas das dos demais. O que ultrapassar o seu limite de gastos fica aguardando a sua aprovação, em vez de ser cobrado.

Três controles, embutidos na camada pela qual sua IA se conecta.

Conjunto curado · 27 capacidades

Entregamos só as ações que importam.

Conjunto de capacidades01 / 07

01-04

4 capacidades neste conjunto.

Parte de 27 disponíveis através de Ensembl.

  1. 01

    Buscar referências cruzadas por símbolo

    Localiza um símbolo externo e retorna os objetos do Ensembl vinculados a ele.

  2. 02

    Recuperar versão de arquivo em massa

    Obtém a versão mais recente para um conjunto de identificadores.

  3. 03

    Obter versão de identificador

    Retorna a versão mais atual de um identificador específico.

  4. 04

    Consultar serviço Beacon GA4GH

    Serviço Beacon para obtenção de informações sobre alelos.

Conjunto de capacidades02 / 07

05-08

4 capacidades neste conjunto.

Parte de 27 disponíveis através de Ensembl.

  1. 05

    Buscar informações de homologia

    Recupera dados de homologia filtrando por espécie e ID do gene.

  2. 06

    Calcular valores de LD

    Realiza o cálculo de desequilíbrio de ligação (Linkage Disequilibrium).

  3. 07

    Busca em massa de identificadores

    Realiza a busca de múltiplos identificadores simultaneamente.

  4. 08

    Pesquisar variantes GA4GH

    Busca por variantes genéticas utilizando o esquema GA4GH.

Conjunto de capacidades03 / 07

09-12

4 capacidades neste conjunto.

Parte de 27 disponíveis através de Ensembl.

  1. 09

    Localizar espécie e banco de dados

    Encontra a espécie e o banco de dados correspondente a um único identificador.

  2. 10

    Converter coordenadas de cDNA

    Transforma coordenadas de cDNA em coordenadas genômicas.

  3. 11

    Buscar termo ontológico

    Pesquisa um termo de ontologia através do seu identificador.

  4. 12

    Encontrar sobreposição de regiões

    Recupera características que se sobrepõem a uma região específica.

Conjunto de capacidades04 / 07

13-16

4 capacidades neste conjunto.

Parte de 27 disponíveis através de Ensembl.

  1. 13

    Testar conexão do serviço

    Verifica se o serviço está ativo e operacional.

  2. 14

    Buscar ID taxonômico

    Pesquisa um termo taxonômico por ID ou nome.

  3. 15

    Recuperar dados de variantes

    Obtém características de variantes, genótipos e dados populacionais.

  4. 16

    Predição de consequências em massa

    Realiza a predição de consequências para múltiplas regiões simultaneamente.

Conjunto de capacidades05 / 07

17-20

4 capacidades neste conjunto.

Parte de 27 disponíveis através de Ensembl.

  1. 17

    Obter consequências em notação HGVS

    Busca as consequências de uma variante formatadas em notação HGVS.

  2. 18

    Recuperar alinhamento genômico

    Obtém alinhamentos genômicos para uma região específica.

  3. 19

    Obter árvore de genes

    Recupera uma árvore de genes para um identificador estável.

  4. 20

    Listar montagens e cromossomos

    Lista as montagens e cromossomos disponíveis para uma determinada espécie.

Conjunto de capacidades06 / 07

21-24

4 capacidades neste conjunto.

Parte de 27 disponíveis através de Ensembl.

  1. 21

    Consultar versão da API REST

    Verifica a versão atual da API REST do Ensembl.

  2. 22

    Listar espécies e metadados

    Lista todas as espécies disponíveis e seus respectivos metadados.

  3. 23

    Mapear coordenadas de montagem

    Converte coordenadas de uma versão de montagem para outra.

  4. 24

    Solicitar sequência por ID

    Solicita uma sequência genômica usando um identificador estável.

Conjunto de capacidades07 / 07

25-27

3 capacidades neste conjunto.

Parte de 27 disponíveis através de Ensembl.

  1. 25

    Solicitar sequência por região

    Solicita uma sequência genômica baseada em uma região específica.

  2. 26

    Buscar consequências por ID de variante

    Busca as consequências para um identificador de variante, como um rsID.

  3. 27

    Recuperar referências externas

    Obtém referências externas para um identificador do Ensembl.

Trabalho real

O que as equipes executam de verdade

01

Orthologue Identification

Find equivalent genes in different species to study evolutionary conservation.

02

Variant Analysis

Predict the biological impact of a mutation using VEP capabilities.

03

Data Normalization

Convert genomic coordinates between different assembly versions to maintain consistency.

04

Database Cross-Referencing

Link Ensembl identifiers to external databases using symbols or IDs.

Automatize uma tarefa

Coloque Ensembl para trabalhar em uma coisa.

Automações passo a passo que sua IA executa por este Connector: o fluxo, os prompts para começar e as capabilities exatas por trás de cada passo.

Um connector, todas as IAs

Ensembl funciona com os clientes de IA mais populares.

Estes são os clientes mais populares, cada um com um guia passo a passo: um link, configurado uma vez, com governança e visibilidade embutidas. E como tudo roda no padrão MCP, a mesma conexão também funciona em qualquer outro cliente compatível — nada para reconstruir.

ClaudeClaudeChatGPTChatGPTGeminiGeminiPerplexityPerplexityGrokGrokMicrosoft CopilotMicrosoft CopilotCursorCursorVS CodeVS CodeWindsurfWindsurfJetBrainsJetBrainsClineClineLangChainLangChainVercel AI SDKVercel AI SDKLovableLovableZ.aiZ.aiRaycastRaycastQwen CodeQwen CodeKimi CodeKimi CodeLe ChatLe Chat

Construindo o seu próprio app? O connector é seu para usar.

Você não precisa de um cliente para colocar Ensembl para trabalhar: a mesma conexão hospedada entra nas suas aplicações e no código do seu agente, com a mesma governança em cada pedido. Construa com ele, converse com ele — uma conexão para os dois.

Observada, não estimada

Média de 1128ms. Rápida em produção.

Ensembl é verificado diariamente contra o serviço em produção.

Média diáriaPico de 1398ms
3 de out.Hoje
Dia mais rápido
913ms
Dia mais lento
1398ms
Tendência de 14 dias
Desacelerando+16%

Conecte seu cliente

Uma URL. Todos os clientes.

Ative o Connector, copie seu link e cole no cliente que você já usa. 27 capacidades chegam prontas para rodar.

Acesso de prévia · não é autenticação no provedor

O token vk_preview_* pertence à infraestrutura de prévia da Vinkius. Ele permite que o Claude descubra e exiba as capacidades de Ensembl, para você ver a experiência dentro da sua IA.

Ele não autentica a sua conta com Ensembl. Ações que exigem credenciais ou dados reais da conta podem não ser executadas até que você ative o Connector e autorize o serviço.

Ensembl Connector

Tudo pronto. Escolha seu cliente MCP e siga as instruções de configuração.

Link do conectorhttps://edge.vinkius.com/vk_preview_m0hayIErvjxLYR70lCwlpWpppEzV8unFkuPlELTW/mcp

Claude Desktop

Siga os passos abaixo para conectar em segundos.

  1. 1In Claude Desktop, open Settings → Connectors.
  2. 2Click “Add custom connector” and paste the connector link above as the remote MCP server URL.
  3. 3Click Add and start a new chat — Ensembl capabilities are ready to use.
Configuração · claude_desktop_config.jsonCopiar
{
  "mcpServers": {
    "ensembl-mcp": {
      "url": "https://edge.vinkius.com/vk_preview_m0hayIErvjxLYR70lCwlpWpppEzV8unFkuPlELTW/mcp"
    }
  }
}
  • Claude
  • ChatGPT
  • Cursor
  • VS Code
  • Windsurf
  • Claude Code
  • JetBrains
  • Cline

Instruções passo a passo para cada cliente estão no guia. Como conectar

Configuração guiada para o Claude? Configurar Ensembl no Claude e outras IAs

Veja todos os clientes de IA com quem este connector funciona ↑

Para quem é

Feito para o trabalho que quem usa Ensembl delega.

Profissionais que lidam com análise de dados biológicos e genômicos em larga escala.

  • 01

    Bioinformáticos

    Para extrair rapidamente árvores de genes e dados de homologia sem precisar escrever scripts em Python ou R.

  • 02

    Pesquisadores Genômicos

    Para verificar versões de IDs estáveis e referências cruzadas diretamente no ambiente de pesquisa.

  • 03

    Cientistas de Dados

    Para automatizar a recuperação de alinhamentos genômicos e metadados para análises biológicas de larga escala.

FAQ

Perguntas de quem usa Ensembl.

  • 01

    Do I need to write code to use this MCP?

    No. You interact with the Ensembl database using natural language through your AI client.

  • 02

    Can I use this with Claude or Cursor?

    Yes. This MCP is compatible with any MCP-enabled client, including Claude, Cursor, and Windsurf.

  • 03

    How do I access the public Ensembl data?

    When setting up your configuration, simply use 'PUBLIC' for standard access to the Ensembl REST API.

  • 04

    What kind of genomic sequences can I get?

    You can request sequences using specific stable identifiers or by defining a genomic region.

  • 05

    Does this support variant prediction?

    Yes. The MCP includes capabilities for bulk consequence prediction and specific HGVS notation queries.

  • 06

    How can I find orthologs for a specific gene across different species?

    Use the get_homology capability by providing the species name and the Ensembl gene ID. You can filter by type (e.g., 'orthologues') to see related genes in other organisms.

  • 07

    Can I retrieve the evolutionary gene tree for a specific identifier?

    Yes! The get_genetree capability allows you to fetch the gene tree for any stable Ensembl ID, with options for alignment and sequence types (protein or cdna).

  • 08

    How do I map a common gene symbol like 'BRCA2' to its Ensembl ID?

    Use the get_xrefs_symbol capability. Provide the species (e.g., 'human') and the symbol 'BRCA2' to retrieve all linked Ensembl objects and their stable identifiers.

Explore

Mais em Databases

Sugestões

Conecte Ensembl ao Claude, Cursor, ChatGPT e outros