Do I need an API key to use this MCP?

No, you can start searching molecular structures immediately after connecting without an API key.

What kind of structures can I find?

You can access over 220,000 experimentally determined 3D structures for proteins, DNA, and RNA.

Which AI clients can use this?

This MCP works with any compatible client, including Claude, Cursor, Windsurf, and VS Code.

Can I search by experimental method?

Yes, you can search for structures determined by X-ray, Cryo-EM, or NMR.

How do I identify a specific structure?

You can use the 4-character PDB ID, such as 1HHO, to get full structural details.

What experimental methods are represented in the PDB?

The PDB contains structures determined by four main methods: X-ray Crystallography (85% of entries, atomic resolution), Cryo-EM (rapidly growing, now 15%+ of new deposits), NMR Spectroscopy (solution-state structures), and Neutron Diffraction (hydrogen atom positions). Each entry lists its method and resolution.

Do I need authentication to access PDB data?

No. RCSB PDB is completely free and open. funded by NSF, NIH, DOE, and international partners. All 220K+ structures are openly accessible without any registration or API key. The data is licensed under CC0 (public domain).

What information does each PDB entry contain?

Each entry includes: PDB ID (4-character code), structure title, depositing authors, experimental method, resolution in Ångströms, source organism, release date, number of polymer chains, and bound non-polymer ligands (drugs, cofactors, ions). Higher resolution (lower number) means more precise atomic coordinates.

An astronaut overseeing a futuristic data hub

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Verbinden Sie RCSB PDB mit ChatGPT, Claude und Gemini

Richten Sie es einmal ein und es funktioniert mit ChatGPT, Claude, Cursor und jedem anderen Client, den Sie lieben. Alles läuft sicher im Hintergrund, damit Sie sich entspannen und sich auf das Wesentliche konzentrieren können. Durchsuchen Sie über 220.000 experimentelle 3D-Daten direkt per KI.

Fragen Sie die KI zu diesem Connector

Entwickelt, gewartet und gehostet von Vinkius.

MCP VERIFIZIERT · PRODUKTIONSREIF · VINKIUS GARANTIE

Waiting for input…

Works with modern AI clients that support MCP, including ChatGPT, Claude, Cursor, and more.

Ihre KI erledigt die Arbeit. Wir halten alles sicher und geschützt.

Kein anderes KI-Tool bietet Ihnen das. Ihr Workflow läuft im Client, den Sie bereits lieben, Ihr Konto bleibt geschützt, und Sie entscheiden, was der Agent darf und was nicht. Das ist der ganze Grund für den Wechsel.

Jeder Connector lebt in unserer Infrastruktur, dort wo Ihr Workflow läuft. Die drei Dinge unten sind bereits Teil davon und arbeiten leise im Hintergrund, damit Sie nie darüber nachdenken müssen. Nichts hinzuzufügen, nichts einzurichten, keine Sorgen.

V8 Isolate01

Jeder Connector läuft in seiner eigenen abgeschotteten Umgebung.

Jeder Connector läuft in einer eigenen abgeriegelten V8-Laufzeit — kein Zugriff auf Ihre Dateien, Ihr System oder andere Server. Ein Connector sieht nie über seine eigene Anfrage hinaus.

Kill-Switch02

Ein Schalter stoppt jeden Agenten. Sofort.

Eine einzige Aktion deaktiviert jeden Connector, entzieht jedes Token und beendet jede Sitzung auf einmal. Die AI Governance bewahrt das Protokoll.

FinOps pro Nutzer03

Ausgabelimits, die anhalten, statt Sie zu überraschen.

Jeder Nutzer behält eigene Verbindungen und Anmeldedaten, isoliert von allen anderen. Was Ihr Ausgabelimit überschreiten würde, wird zurückgehalten und wartet auf Ihre Freigabe, anstatt abgerechnet zu werden.

Drei Kontrollen, eingebaut in die Schicht, über die sich Ihre KI verbindet.

Kuratiertes Set · 2 Fähigkeiten

Wir liefern nur die Aktionen, die zählen.

Fähigkeiten-Set01 / 01

01-02

2 Fähigkeiten in diesem Set.

Teil von 2, verfügbar über RCSB PDB.

01
PDB-Struktur abrufen
Nutzen Sie die 4-stelligen PDB-IDs wie 1HHO oder 6LU7, um vollständige strukturelle Details abzurufen. Erhalten Sie Informationen zu Methoden, Auflösungen und gebundenen Molekülen.
02
PDB-Datenbank durchsuchen
Suchen Sie in über 220.000 Einträgen nach Proteinen, DNA oder RNA. Finden Sie Details zu experimentellen Methoden, Autoren und Liganden für die Wirkstoffforschung.

Echte Arbeit

Was Teams täglich ausführen

Target Identification

Search for protein structures associated with specific diseases to begin research.

Ligand Screening

Find co-crystal structures to identify how specific molecules bind to a target protein.

Method Comparison

Query different experimental methods like Cryo-EM or X-ray to compare structural resolutions.

Data Verification

Check the resolution and authorship of a specific PDB entry via your agent.

Eine Aufgabe automatisieren

Bringen Sie RCSB PDB für eine Sache an die Arbeit.

Schritt-für-Schritt-Automatisierungen, die Ihre KI über diesen Connector ausführt: der Ablauf, die Prompts für den Einstieg und die genauen Fähigkeiten hinter jedem Schritt.

Ein Connector, jede KI

RCSB PDB funktioniert mit den beliebtesten KI-Clients.

Dies sind die beliebtesten Clients, jeder mit einer Schritt-für-Schritt-Anleitung: ein Link, einmal eingerichtet, mit Governance und Sichtbarkeit an Bord. Und da alles auf dem MCP-Standard läuft, funktioniert dieselbe Verbindung auch in jedem anderen kompatiblen Client — nichts neu zu bauen.

Bauen Sie Ihre eigene App? Der Connector gehört Ihnen.

Sie brauchen keinen Client, um RCSB PDB arbeiten zu lassen: dieselbe gehostete Verbindung speist Ihre eigenen Anwendungen und Ihren Agenten-Code, mit derselben Governance bei jeder Anfrage. Damit bauen, damit chatten — eine Verbindung für beides.

Beobachtet, nicht geschätzt

Durchschnitt 907ms. Schnell in der Produktion.

RCSB PDB wird täglich gegen den Live-Service geprüft.

TagesdurchschnittSpitze 1080ms

3. Okt.Heute

Schnellster Tag: 730ms
Langsamster Tag: 1080ms
14-Tage-Trend: Verlangsamend+19%

Verbinden Sie Ihren Client

Eine URL. Jeder Client.

Aktivieren Sie den Connector, kopieren Sie Ihren Link und fügen Sie ihn in den Client ein, den Sie bereits nutzen. 2 Fähigkeiten kommen einsatzbereit an.

Vorschauzugang · keine Anbieter-Authentifizierung

Das vk_preview_*-Token gehört zur Vorschau-Infrastruktur von Vinkius. Es ermöglicht Claude, die Fähigkeiten von RCSB PDB zu entdecken und anzuzeigen, damit Sie das Erlebnis in Ihrer KI sehen.

Es authentifiziert Ihr Konto nicht bei RCSB PDB. Aktionen, die Anmeldedaten oder echte Kontodaten erfordern, werden möglicherweise erst ausgeführt, wenn Sie den Connector aktivieren und den Dienst autorisieren.

RCSB PDB Connector

Alles bereit. Wählen Sie Ihren MCP-Client und folgen Sie den Einrichtungsschritten.

Connector-Linkhttps://edge.vinkius.com/vk_preview_px4KJXLkPAfRiw8dj06D8ILeCL0RIsHNqISA0zQD/mcp

Claude Desktop

Folgen Sie den Schritten unten, um sich in Sekunden zu verbinden.

1In Claude Desktop, open Settings → Connectors.
2Click “Add custom connector” and paste the connector link above as the remote MCP server URL.
3Click Add and start a new chat — RCSB PDB capabilities are ready to use.

Konfiguration · claude_desktop_config.jsonKopieren

{
  "mcpServers": {
    "rcsb-pdb-mcp": {
      "url": "https://edge.vinkius.com/vk_preview_px4KJXLkPAfRiw8dj06D8ILeCL0RIsHNqISA0zQD/mcp"
    }
  }
}

Claude
ChatGPT
Cursor
VS Code
Windsurf
Claude Code
JetBrains
Cline

Schritt-für-Schritt-Anleitungen für jeden Client finden Sie im Guide. Verbinden

Geführte Einrichtung für Claude? RCSB PDB in Claude und anderen KI-Tools einrichten

Alle KI-Clients ansehen, mit denen dieser Connector funktioniert ↑

Für wen

Für die Arbeit, die RCSB PDB-Nutzer abgeben.

Dieser MCP-Connector richtet sich an Fachleute aus der biologischen Forschung und der pharmazeutischen Entwicklung.

01
Strukturbiologen
Schneller Zugriff auf experimentelle Metadaten, Auflösungen und Methodendetails für Molekülstrukturen.
02
Teams der Wirkstoffforschung
Identifizierung von Protein-Ligand-Ko-Kristallstrukturen für das strukturierte Wirkstoffdesign und virtuelles Screening.
03
Biochemie-Studierende
Verständnis der Proteinstruktur durch die Untersuchung realer experimenteller Strukturen mit Annotationen.

FAQ

Fragen von RCSB PDB-Nutzern.

01
Do I need an API key to use this MCP?
No, you can start searching molecular structures immediately after connecting without an API key.
02
What kind of structures can I find?
You can access over 220,000 experimentally determined 3D structures for proteins, DNA, and RNA.
03
Which AI clients can use this?
This MCP works with any compatible client, including Claude, Cursor, Windsurf, and VS Code.
04
Can I search by experimental method?
Yes, you can search for structures determined by X-ray, Cryo-EM, or NMR.
05
How do I identify a specific structure?
You can use the 4-character PDB ID, such as 1HHO, to get full structural details.
06
What experimental methods are represented in the PDB?
The PDB contains structures determined by four main methods: X-ray Crystallography (85% of entries, atomic resolution), Cryo-EM (rapidly growing, now 15%+ of new deposits), NMR Spectroscopy (solution-state structures), and Neutron Diffraction (hydrogen atom positions). Each entry lists its method and resolution.
07
Do I need authentication to access PDB data?
No. RCSB PDB is completely free and open. funded by NSF, NIH, DOE, and international partners. All 220K+ structures are openly accessible without any registration or API key. The data is licensed under CC0 (public domain).
08
What information does each PDB entry contain?
Each entry includes: PDB ID (4-character code), structure title, depositing authors, experimental method, resolution in Ångströms, source organism, release date, number of polymer chains, and bound non-polymer ligands (drugs, cofactors, ions). Higher resolution (lower number) means more precise atomic coordinates.