An astronaut overseeing a futuristic data hub
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Conecta Ensembl a ChatGPT, Claude y Gemini

Configúralo una vez y funciona en ChatGPT, Claude, Cursor y en cualquier otro cliente que te guste. Todo se ejecuta con seguridad en segundo plano, para que tú te relajes y te centres en lo que de verdad importa. Consulta datos biológicos complejos mediante lenguaje natural.

Pregunta a la IA sobre este Connector

Desarrollado, mantenido y alojado por Vinkius.

MCP VERIFICADO · LISTO PARA PRODUCCIÓN · GARANTÍA VINKIUS

Waiting for input…

Works with modern AI clients that support MCP, including ChatGPT, Claude, Cursor, and more.

ChatGPTClaudeCursorPerplexityGeminiMicrosoft CopilotRaycastMeta AI

Tu IA hace el trabajo. Nosotros lo cuidamos, seguro.

Ninguna otra herramienta de IA te da esto. Tu workflow se ejecuta en el cliente que ya amas, tu cuenta permanece protegida y tú decides lo que el agente puede y no puede hacer. Es la razón completa para dar el salto.

Cada Connector vive dentro de nuestra infraestructura, en el mismo lugar donde se ejecuta tu workflow. Las tres cosas de abajo ya forman parte de él, trabajando en silencio en segundo plano para que nunca tengas que pensar en ellas. Nada que añadir, nada que configurar, nada de qué preocuparte.

A futuristic MCP client docking bay
V8 Isolate01

Cada Connector se ejecuta dentro de su propio entorno sellado.

Cada Connector se ejecuta en su propio runtime V8 aislado, sin acceso a tus archivos, a tu sistema ni a otros servidores. Un Connector nunca ve más allá de su propia petición.

Kill Switch02

Un interruptor detiene a todos los agentes. Al instante.

Una única acción desactiva todos los Connectors, revoca todos los tokens y cierra todas las sesiones a la vez. La Gobernanza de IA guarda el registro.

FinOps por usuario03

Límites de gasto que se pausan en vez de sorprenderte.

Cada usuario mantiene sus propias conexiones y credenciales, aisladas de las de los demás. Lo que supere tu límite de gasto se detiene y queda esperando tu aprobación en vez de cobrarse.

Tres controles, integrados en la capa por donde tu IA se conecta.

Set curado · 27 capacidades

Publicamos solo las acciones que importan.

Set de capacidades01 / 07

01-04

4 capacidades en este set.

Parte de 27 disponibles a través de Ensembl.

  1. 01

    Buscar referencias cruzadas

    Busca un símbolo externo y devuelve los objetos de Ensembl vinculados.

  2. 02

    Consulta de archivo masiva

    Obtiene la versión más reciente para un conjunto de identificadores.

  3. 03

    Versión de identificador

    Devuelve la versión más reciente de un identificador específico.

  4. 04

    Servicio de alelos Beacon

    Servicio Beacon para obtener información sobre alelos.

Set de capacidades02 / 07

05-08

4 capacidades en este set.

Parte de 27 disponibles a través de Ensembl.

  1. 05

    Consultar homologías

    Recupera información de homología por especie e ID de gen.

  2. 06

    Calcular desequilibrio de ligamiento

    Calcula los valores de Linkage Disequilibrium (LD).

  3. 07

    Búsqueda masiva de identificadores

    Realiza búsquedas masivas para múltiples identificadores.

  4. 08

    Buscar variantes GA4GH

    Busca variantes utilizando el esquema GA4GH.

Set de capacidades03 / 07

09-12

4 capacidades en este set.

Parte de 27 disponibles a través de Ensembl.

  1. 09

    Identificar especie y base de datos

    Encuentra la especie y la base de datos para un único identificador.

  2. 10

    Mapear coordenadas cDNA

    Convierte coordenadas de cDNA en coordenadas genómicas.

  3. 11

    Buscar término ontológico

    Busca un término ontológico mediante su identificador.

  4. 12

    Buscar regiones superpuestas

    Recupera las características que se superponen a una región específica.

Set de capacidades04 / 07

13-16

4 capacidades en este set.

Parte de 27 disponibles a través de Ensembl.

  1. 13

    Comprobar estado del servicio

    Verifica si el servicio está activo y operativo.

  2. 14

    Buscar término taxonómico

    Busca un término taxonómico por su ID o nombre.

  3. 15

    Consultar variantes y genotipos

    Recupera características de variantes, genotipos y datos poblacionales.

  4. 16

    Predicción masiva de consecuencias

    Realiza predicciones de consecuencias para múltiples regiones de forma masiva.

Set de capacidades05 / 07

17-20

4 capacidades en este set.

Parte de 27 disponibles a través de Ensembl.

  1. 17

    Consecuencias en formato HGVS

    Obtiene las consecuencias de una variante en notación HGVS.

  2. 18

    Obtener alineamiento genómico

    Recupera alineamientos genómicos para una región específica.

  3. 19

    Obtener árbol de genes

    Recupera un árbol de genes para un identificador estable.

  4. 20

    Listar ensamblajes y cromosomas

    Muestra los ensamblajes y cromosomas disponibles para una especie.

Set de capacidades06 / 07

21-24

4 capacidades en este set.

Parte de 27 disponibles a través de Ensembl.

  1. 21

    Consultar versión de la API

    Muestra la versión actual de la API REST de Ensembl.

  2. 22

    Listar especies disponibles

    Muestra todas las especies disponibles y sus metadatos.

  3. 23

    Mapear entre ensamblajes

    Convierte coordenadas de una versión de ensamblaje a otra.

  4. 24

    Solicitar secuencia por ID

    Solicita una secuencia utilizando un identificador estable.

Set de capacidades07 / 07

25-27

3 capacidades en este set.

Parte de 27 disponibles a través de Ensembl.

  1. 25

    Solicitar secuencia por región

    Solicita una secuencia genómica basada en una región específica.

  2. 26

    Consecuencias por identificador de variante

    Obtiene las consecuencias para un identificador de variante, como un rsID.

  3. 27

    Obtener referencias externas

    Recupera referencias externas para un identificador de Ensembl.

Trabajo real

Lo que los equipos ejecutan de verdad

01

Orthologue Identification

Find equivalent genes in different species to study evolutionary conservation.

02

Variant Analysis

Predict the biological impact of a mutation using VEP capabilities.

03

Data Normalization

Convert genomic coordinates between different assembly versions to maintain consistency.

04

Database Cross-Referencing

Link Ensembl identifiers to external databases using symbols or IDs.

Automatiza una tarea

Pon Ensembl a trabajar en una cosa.

Automatizaciones paso a paso que tu IA ejecuta a través de este Connector: el flujo de trabajo, los prompts para empezar y las capabilities exactas detrás de cada paso.

Un connector, todas las IAs

Ensembl funciona con los clientes de IA más populares.

Estos son los clientes más populares, cada uno con una guía paso a paso: un enlace, configurado una vez, con gobernanza y visibilidad integradas. Y como todo corre sobre el estándar MCP, la misma conexión también funciona en cualquier otro cliente compatible: nada que reconstruir.

ClaudeClaudeChatGPTChatGPTGeminiGeminiPerplexityPerplexityGrokGrokMicrosoft CopilotMicrosoft CopilotCursorCursorVS CodeVS CodeWindsurfWindsurfJetBrainsJetBrainsClineClineLangChainLangChainVercel AI SDKVercel AI SDKLovableLovableZ.aiZ.aiRaycastRaycastQwen CodeQwen CodeKimi CodeKimi CodeLe ChatLe Chat

¿Construyendo tu propia app? El connector es tuyo para usar.

No necesitas un cliente para poner Ensembl a trabajar: la misma conexión alojada se conecta a tus propias aplicaciones y al código de tu agente, con la misma gobernanza en cada petición. Construye con él, conversa con él: una conexión para ambos.

Observada, no estimada

Promedio de 1128ms. Rápida en producción.

Ensembl se verifica a diario contra el servicio en producción.

Promedio diarioPico de 1398ms
3 octHoy
Día más rápido
913ms
Día más lento
1398ms
Tendencia de 14 días
Ralentizando+16%

Conecta tu cliente

Una URL. Todos los clientes.

Activa el Connector, copia tu enlace y pégalo en el cliente que ya usas. 27 capacidades llegan listas para funcionar.

Acceso de vista previa · no es autenticación del proveedor

El token vk_preview_* pertenece a la infraestructura de vista previa de Vinkius. Permite que Claude descubra y muestre las capacidades de Ensembl, para que veas la experiencia dentro de tu IA.

No autentica tu cuenta con Ensembl. Las acciones que requieran credenciales o datos reales de la cuenta podrían no ejecutarse hasta que actives el Connector y autorices el servicio.

Ensembl Connector

Todo listo. Elige tu cliente MCP y sigue las instrucciones de configuración.

Enlace del conectorhttps://edge.vinkius.com/vk_preview_m0hayIErvjxLYR70lCwlpWpppEzV8unFkuPlELTW/mcp

Claude Desktop

Sigue los pasos siguientes para conectarte en segundos.

  1. 1In Claude Desktop, open Settings → Connectors.
  2. 2Click “Add custom connector” and paste the connector link above as the remote MCP server URL.
  3. 3Click Add and start a new chat — Ensembl capabilities are ready to use.
Configuración · claude_desktop_config.jsonCopiar
{
  "mcpServers": {
    "ensembl-mcp": {
      "url": "https://edge.vinkius.com/vk_preview_m0hayIErvjxLYR70lCwlpWpppEzV8unFkuPlELTW/mcp"
    }
  }
}
  • Claude
  • ChatGPT
  • Cursor
  • VS Code
  • Windsurf
  • Claude Code
  • JetBrains
  • Cline

Las instrucciones paso a paso para cada cliente están en la guía. Cómo conectar

¿Configuración guiada para Claude? Conectar Ensembl con Claude y otras IA

Ve todos los clientes de IA con los que funciona este connector ↑

Para quién es

Hecho para el trabajo que quienes usan Ensembl delegan.

Diseñado para profesionales que trabajan con datos biológicos a gran escala y necesitan integrar la genómica en sus flujos de trabajo de IA.

  • 01

    Bioinformáticos

    Para extraer árboles de genes y datos de homología sin escribir scripts personalizados en Python o R.

  • 02

    Investigadores genómicos

    Para verificar versiones de IDs estables y referencias cruzadas directamente en su entorno de investigación.

  • 03

    Científicos de datos

    Para automatizar la recuperación de alineamientos genómicos y metadatos para análisis biológicos masivos.

FAQ

Preguntas de quienes usan Ensembl.

  • 01

    Do I need to write code to use this MCP?

    No. You interact with the Ensembl database using natural language through your AI client.

  • 02

    Can I use this with Claude or Cursor?

    Yes. This MCP is compatible with any MCP-enabled client, including Claude, Cursor, and Windsurf.

  • 03

    How do I access the public Ensembl data?

    When setting up your configuration, simply use 'PUBLIC' for standard access to the Ensembl REST API.

  • 04

    What kind of genomic sequences can I get?

    You can request sequences using specific stable identifiers or by defining a genomic region.

  • 05

    Does this support variant prediction?

    Yes. The MCP includes capabilities for bulk consequence prediction and specific HGVS notation queries.

  • 06

    How can I find orthologs for a specific gene across different species?

    Use the get_homology capability by providing the species name and the Ensembl gene ID. You can filter by type (e.g., 'orthologues') to see related genes in other organisms.

  • 07

    Can I retrieve the evolutionary gene tree for a specific identifier?

    Yes! The get_genetree capability allows you to fetch the gene tree for any stable Ensembl ID, with options for alignment and sequence types (protein or cdna).

  • 08

    How do I map a common gene symbol like 'BRCA2' to its Ensembl ID?

    Use the get_xrefs_symbol capability. Provide the species (e.g., 'human') and the symbol 'BRCA2' to retrieve all linked Ensembl objects and their stable identifiers.

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