An astronaut overseeing a futuristic data hub
Descargar PDFVersión en Markdown

Conecta Protein-Ligand Docking Score a ChatGPT y Claude

Configúralo una vez y funciona en ChatGPT, Claude, Cursor y en cualquier otro cliente que te guste. Todo se ejecuta con seguridad en segundo plano, para que tú te relajes y te centres en lo que de verdad importa. Evalúa la afinidad de unión y la estabilidad de complejos químicos.

Pregunta a la IA sobre este Connector

Desarrollado, mantenido y alojado por Vinkius.

MCP VERIFICADO · LISTO PARA PRODUCCIÓN · GARANTÍA VINKIUS

Waiting for input…

Works with modern AI clients that support MCP, including ChatGPT, Claude, Cursor, and more.

ChatGPTClaudeCursorPerplexityGeminiMicrosoft CopilotRaycastMeta AI

Tu IA hace el trabajo. Nosotros lo cuidamos, seguro.

Ninguna otra herramienta de IA te da esto. Tu workflow se ejecuta en el cliente que ya amas, tu cuenta permanece protegida y tú decides lo que el agente puede y no puede hacer. Es la razón completa para dar el salto.

Cada Connector vive dentro de nuestra infraestructura, en el mismo lugar donde se ejecuta tu workflow. Las tres cosas de abajo ya forman parte de él, trabajando en silencio en segundo plano para que nunca tengas que pensar en ellas. Nada que añadir, nada que configurar, nada de qué preocuparte.

A futuristic MCP client docking bay
V8 Isolate01

Cada Connector se ejecuta dentro de su propio entorno sellado.

Cada Connector se ejecuta en su propio runtime V8 aislado, sin acceso a tus archivos, a tu sistema ni a otros servidores. Un Connector nunca ve más allá de su propia petición.

Kill Switch02

Un interruptor detiene a todos los agentes. Al instante.

Una única acción desactiva todos los Connectors, revoca todos los tokens y cierra todas las sesiones a la vez. La Gobernanza de IA guarda el registro.

FinOps por usuario03

Límites de gasto que se pausan en vez de sorprenderte.

Cada usuario mantiene sus propias conexiones y credenciales, aisladas de las de los demás. Lo que supere tu límite de gasto se detiene y queda esperando tu aprobación en vez de cobrarse.

Tres controles, integrados en la capa por donde tu IA se conecta.

Set curado · 4 capacidades

Publicamos solo las acciones que importan.

Set de capacidades01 / 01

01-04

4 capacidades en este set.

Parte de 4 disponibles a través de Protein-Ligand Docking Score.

  1. 01

    Comparar poses

    Compara múltiples configuraciones de docking para identificar el modo de unión más estable.

  2. 02

    Calcular energía de unión

    Calcula la afinidad de unión total estimada para una pose de docking específica.

  3. 03

    Identificar sitio de unión

    Mapea los residuos proteicos específicos que se encuentran en proximidad inmediata al ligando.

  4. 04

    Analizar interacciones

    Identifica y categoriza los tipos de enlaces químicos formados entre el ligando y la proteína.

Trabajo real

Lo que los equipos ejecutan de verdad

01

Lead Optimization

Compare different ligand modifications to see which one produces the most stable binding energy.

02

Binding Site Characterization

Identify the specific residues that form salt bridges or hydrogen bonds with a new drug candidate.

03

Docking Pose Validation

Rank a set of generated docking poses to determine the most likely binding mode.

04

Interaction Profiling

Quickly get a list of all residues in the immediate vicinity of a ligand.

Un connector, todas las IAs

Protein-Ligand Docking Score funciona con los clientes de IA más populares.

Estos son los clientes más populares, cada uno con una guía paso a paso: un enlace, configurado una vez, con gobernanza y visibilidad integradas. Y como todo corre sobre el estándar MCP, la misma conexión también funciona en cualquier otro cliente compatible: nada que reconstruir.

ClaudeClaudeChatGPTChatGPTGeminiGeminiPerplexityPerplexityGrokGrokMicrosoft CopilotMicrosoft CopilotCursorCursorVS CodeVS CodeWindsurfWindsurfJetBrainsJetBrainsClineClineLangChainLangChainVercel AI SDKVercel AI SDKLovableLovableZ.aiZ.aiRaycastRaycastQwen CodeQwen CodeKimi CodeKimi CodeLe ChatLe Chat

¿Construyendo tu propia app? El connector es tuyo para usar.

No necesitas un cliente para poner Protein-Ligand Docking Score a trabajar: la misma conexión alojada se conecta a tus propias aplicaciones y al código de tu agente, con la misma gobernanza en cada petición. Construye con él, conversa con él: una conexión para ambos.

Observada, no estimada

Promedio de 875ms. Rápida en producción.

Protein-Ligand Docking Score se verifica a diario contra el servicio en producción.

Promedio diarioPico de 1051ms
3 octHoy
Día más rápido
787ms
Día más lento
1051ms
Tendencia de 14 días
Mejorando-7%

Conecta tu cliente

Una URL. Todos los clientes.

Activa el Connector, copia tu enlace y pégalo en el cliente que ya usas. 4 capacidades llegan listas para funcionar.

Acceso de vista previa · no es autenticación del proveedor

El token vk_preview_* pertenece a la infraestructura de vista previa de Vinkius. Permite que Claude descubra y muestre las capacidades de Protein-Ligand Docking Score, para que veas la experiencia dentro de tu IA.

No autentica tu cuenta con Protein-Ligand Docking Score. Las acciones que requieran credenciales o datos reales de la cuenta podrían no ejecutarse hasta que actives el Connector y autorices el servicio.

Protein-Ligand Docking Score Connector

Todo listo. Elige tu cliente MCP y sigue las instrucciones de configuración.

Enlace del conectorhttps://edge.vinkius.com/vk_preview_ciuUzOG1Qnl6b5M4bg8GJvku5vmnaipFWSX2VIUv/mcp

Claude Desktop

Sigue los pasos siguientes para conectarte en segundos.

  1. 1In Claude Desktop, open Settings → Connectors.
  2. 2Click “Add custom connector” and paste the connector link above as the remote MCP server URL.
  3. 3Click Add and start a new chat — Protein-Ligand Docking Score capabilities are ready to use.
Configuración · claude_desktop_config.jsonCopiar
{
  "mcpServers": {
    "protein-ligand-docking-score-mcp": {
      "url": "https://edge.vinkius.com/vk_preview_ciuUzOG1Qnl6b5M4bg8GJvku5vmnaipFWSX2VIUv/mcp"
    }
  }
}
  • Claude
  • ChatGPT
  • Cursor
  • VS Code
  • Windsurf
  • Claude Code
  • JetBrains
  • Cline

Las instrucciones paso a paso para cada cliente están en la guía. Cómo conectar

¿Configuración guiada para Claude? Conectar Protein-Ligand Docking Score con Claude y otras IA

Ve todos los clientes de IA con los que funciona este connector ↑

Para quién es

Hecho para el trabajo que quienes usan Protein-Ligand Docking Score delegan.

Este MCP está diseñado para profesionales de la química computacional y la biología estructural que trabajan en el diseño de fármacos.

  • 01

    Químicos computacionales

    Para modelar interacciones moleculares y predecir la afinidad de nuevos compuestos.

  • 02

    Investigadores de fármacos

    Para evaluar la estabilidad de complejos proteína-ligando durante el cribado virtual.

  • 03

    Biólogos estructurales

    Para identificar residuos clave y tipos de enlaces en sitios de unión específicos.

FAQ

Preguntas de quienes usan Protein-Ligand Docking Score.

  • 01

    What can this MCP do with docking poses?

    It evaluates binding affinity, identifies chemical bonds, maps contact residues, and ranks different docking configurations.

  • 02

    Does it account for solvation in energy calculations?

    Yes, the get_binding_energy capability includes solvation and entropy effects in its total affinity calculation.

  • 03

    Which AI clients can I use with this MCP?

    You can use any MCP-compatible client, such as Claude, Cursor, Windsurf, or VS Code.

  • 04

    How does it identify chemical bonds?

    The analyze_interactions capability identifies and categorizes specific bonds like hydrogen bonds and salt bridges.

  • 05

    Can I use this to find the best binding mode?

    Yes, the compare_poses capability is designed to rank multiple configurations to find the most stable mode.

  • 06

    How do I calculate the total binding affinity?

    You can use the get_binding_energy capability by providing a valid poseId. You can also optionally include solvation and entropy effects in the calculation.

  • 07

    Can I see which amino acids are interacting with my ligand?

    Yes, the identify_binding_site capability maps the specific protein residues in immediate proximity to the ligand based on a distance threshold.

  • 08

    How can I find the most stable docking configuration?

    Use the compare_poses capability with a list of poseIds to rank multiple configurations and identify the best binding mode.

Explora

Más en Chemistry

Sugerencias

Conecta Protein-Ligand Docking Score a Claude, Cursor, ChatGPT y más