An astronaut overseeing a futuristic data hub
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Connectez Ensembl à ChatGPT, Claude et Gemini

Configurez-le une fois et il fonctionne avec ChatGPT, Claude, Cursor et n'importe quel autre client que vous aimez. Tout s'exécute en toute sécurité en arrière-plan, pour que vous puissiez vous détendre et vous concentrer sur l'essentiel. Analysez les séquences et les homologies par simple dialogue.

Demandez à l'IA à propos de ce Connector

Développé, maintenu et hébergé par Vinkius.

MCP VÉRIFIÉ · PRÊT POUR LA PRODUCTION · GARANTIE VINKIUS

Waiting for input…

Works with modern AI clients that support MCP, including ChatGPT, Claude, Cursor, and more.

ChatGPTClaudeCursorPerplexityGeminiMicrosoft CopilotRaycastMeta AI

Votre IA fait le travail. Nous veillons dessus, en toute sécurité.

Aucun autre outil d'IA ne vous offre ça. Votre workflow s'exécute dans le client que vous aimez déjà, votre compte reste protégé, et vous décidez ce que l'agent peut ou ne peut pas faire. C'est la vraie raison de faire le pas.

Chaque Connector vit dans notre infrastructure, là où votre workflow s'exécute. Les trois choses ci-dessous en font déjà partie et travaillent discrètement en arrière-plan pour que vous n'ayez jamais à y penser. Rien à ajouter, rien à configurer, aucune inquiétude à avoir.

A futuristic MCP client docking bay
V8 Isolate01

Chaque Connector s'exécute dans son propre environnement scellé.

Chaque Connector s'exécute dans son propre runtime V8 scellé, sans accès à vos fichiers, à votre système ni aux autres serveurs. Un Connector ne voit jamais au-delà de sa propre requête.

Kill Switch02

Un seul interrupteur arrête tous les agents. Immédiatement.

Une seule action désactive tous les Connectors, révoque tous les tokens et termine toutes les sessions d'un coup. La Gouvernance de l'IA conserve le registre.

FinOps par utilisateur03

Des limites de dépense qui s'interrompent au lieu de surprendre.

Chaque utilisateur garde ses propres connexions et identifiants, isolés de ceux des autres. Ce qui dépasserait votre limite de dépense est stoppé et mis en attente de votre approbation, pas facturé.

Trois contrôles, intégrés à la couche par laquelle votre IA se connecte.

Sélection · 27 capacités

Nous ne livrons que les actions qui comptent.

Ensemble de capacités01 / 07

01-04

4 capacités dans cet ensemble.

Sur 27 disponibles via Ensembl.

  1. 01

    Rechercher des références croisées

    Recherche un symbole externe et renvoie les objets Ensembl associés.

  2. 02

    Récupérer l'archive en masse

    Récupère la version la plus récente pour un ensemble d'identifiants.

  3. 03

    Obtenir la version d'un identifiant

    Renvoie la version la plus récente d'un identifiant donné.

  4. 04

    Consulter le service Beacon

    Service Beacon pour obtenir des informations sur les allèles.

Ensemble de capacités02 / 07

05-08

4 capacités dans cet ensemble.

Sur 27 disponibles via Ensembl.

  1. 05

    Rechercher des homologies

    Récupère les informations d'homologie par espèce et par ID de gène.

  2. 06

    Calculer le déséquilibre de liaison

    Calcule les valeurs de Linkage Disequilibrium (LD).

  3. 07

    Recherche massive d'identifiants

    Effectue une recherche groupée pour plusieurs identifiants.

  4. 08

    Rechercher des variants GA4GH

    Recherche des variants en utilisant le schéma GA4GH.

Ensemble de capacités03 / 07

09-12

4 capacités dans cet ensemble.

Sur 27 disponibles via Ensembl.

  1. 09

    Identifier l'espèce et la base

    Trouve l'espèce et la base de données pour un identifiant unique.

  2. 10

    Convertir les coordonnées cDNA

    Convertit les coordonnées cDNA en coordonnées génomiques.

  3. 11

    Rechercher un terme ontologique

    Recherche un terme ontologique par son identifiant.

  4. 12

    Trouver des régions chevauchantes

    Récupère les caractéristiques chevauchant une région spécifique.

Ensemble de capacités04 / 07

13-16

4 capacités dans cet ensemble.

Sur 27 disponibles via Ensembl.

  1. 13

    Tester la connexion

    Vérifie si le service est opérationnel.

  2. 14

    Rechercher un terme taxonomique

    Recherche un terme taxonomique par ID ou par nom.

  3. 15

    Récupérer des données de variation

    Récupère les caractéristiques des variants, les génotypes et les données de population.

  4. 16

    Prédiction de conséquences en masse

    Prédiction groupée des conséquences pour plusieurs régions.

Ensemble de capacités05 / 07

17-20

4 capacités dans cet ensemble.

Sur 27 disponibles via Ensembl.

  1. 17

    Obtenir les conséquences HGVS

    Récupère les conséquences d'un variant en notation HGVS.

  2. 18

    Récupérer un alignement

    Récupère les alignements génomiques pour une région spécifique.

  3. 19

    Extraire un arbre de gènes

    Récupère un arbre de gènes pour un identifiant stable.

  4. 20

    Lister les assemblages

    Liste les assemblages et chromosomes disponibles pour une espèce.

Ensemble de capacités06 / 07

21-24

4 capacités dans cet ensemble.

Sur 27 disponibles via Ensembl.

  1. 21

    Vérifier la version de l'API

    Indique la version actuelle de l'API REST d'Ensembl.

  2. 22

    Lister les espèces

    Liste toutes les espèces disponibles et leurs métadonnées.

  3. 23

    Convertir les coordonnées

    Convertit les coordonnées d'une version d'assemblage à une autre.

  4. 24

    Récupérer une séquence par ID

    Demande une séquence à partir d'un identifiant stable.

Ensemble de capacités07 / 07

25-27

3 capacités dans cet ensemble.

Sur 27 disponibles via Ensembl.

  1. 25

    Récupérer une séquence par région

    Demande une séquence génomique pour une région donnée.

  2. 26

    Obtenir les conséquences d'un variant

    Récupère les conséquences pour un identifiant de variant (ex: rsID).

  3. 27

    Récupérer les références externes

    Récupère les références externes pour un identifiant Ensembl.

Travail réel

Ce que les équipes font tourner

01

Orthologue Identification

Find equivalent genes in different species to study evolutionary conservation.

02

Variant Analysis

Predict the biological impact of a mutation using VEP capabilities.

03

Data Normalization

Convert genomic coordinates between different assembly versions to maintain consistency.

04

Database Cross-Referencing

Link Ensembl identifiers to external databases using symbols or IDs.

Automatisez une tâche

Mettez Ensembl au travail sur une chose.

Des automatisations étape par étape que votre IA exécute via ce Connector : le flux, les prompts pour démarrer et les capabilities exactes derrière chaque étape.

Un connector, toutes les IAs

Ensembl fonctionne avec les clients IA les plus populaires.

Voici les clients les plus populaires, chacun avec un guide pas à pas : un lien, configuré une fois, avec gouvernance et visibilité intégrées. Et comme tout tourne sur le standard MCP, la même connexion fonctionne aussi dans tout autre client compatible : rien à reconstruire.

ClaudeClaudeChatGPTChatGPTGeminiGeminiPerplexityPerplexityGrokGrokMicrosoft CopilotMicrosoft CopilotCursorCursorVS CodeVS CodeWindsurfWindsurfJetBrainsJetBrainsClineClineLangChainLangChainVercel AI SDKVercel AI SDKLovableLovableZ.aiZ.aiRaycastRaycastQwen CodeQwen CodeKimi CodeKimi CodeLe ChatLe Chat

Vous construisez votre propre app ? Le connector est à vous.

Vous n'avez pas besoin d'un client pour mettre Ensembl au travail : la même connexion hébergée se branche sur vos propres applications et le code de votre agent, avec la même gouvernance à chaque requête. Construisez avec lui, discutez avec lui : une connexion pour les deux.

Observée, pas estimée

Moyenne de 1128 ms. Rapide en production.

Ensembl est vérifié quotidiennement contre le service en production.

Moyenne quotidiennePic à 1398 ms
3 oct.Aujourd'hui
Jour le plus rapide
913ms
Jour le plus lent
1398ms
Tendance sur 14 jours
En ralentissement+16%

Connectez votre client

Une URL. Tous les clients.

Activez le Connector, copiez votre lien et collez-le dans le client que vous utilisez déjà. 27 capacités arrivent prêtes à l'emploi.

Accès aperçu · pas d’authentification du fournisseur

Le jeton vk_preview_* appartient à l’infrastructure d’aperçu de Vinkius. Il permet à Claude de découvrir et d’afficher les capacités de Ensembl, pour que vous voyiez l’expérience dans votre IA.

Il n’authentifie pas votre compte auprès de Ensembl. Les actions nécessitant des identifiants ou des données de compte réelles peuvent ne pas s’exécuter tant que vous n’avez pas activé le Connector et autorisé le service.

Ensembl Connector

Tout est prêt. Choisissez votre client MCP et suivez les instructions de configuration.

Lien du connecteurhttps://edge.vinkius.com/vk_preview_m0hayIErvjxLYR70lCwlpWpppEzV8unFkuPlELTW/mcp

Claude Desktop

Suivez les étapes ci-dessous pour vous connecter en quelques secondes.

  1. 1In Claude Desktop, open Settings → Connectors.
  2. 2Click “Add custom connector” and paste the connector link above as the remote MCP server URL.
  3. 3Click Add and start a new chat — Ensembl capabilities are ready to use.
Configuration · claude_desktop_config.jsonCopier
{
  "mcpServers": {
    "ensembl-mcp": {
      "url": "https://edge.vinkius.com/vk_preview_m0hayIErvjxLYR70lCwlpWpppEzV8unFkuPlELTW/mcp"
    }
  }
}
  • Claude
  • ChatGPT
  • Cursor
  • VS Code
  • Windsurf
  • Claude Code
  • JetBrains
  • Cline

Les instructions pas à pas pour chaque client sont dans le guide. Comment connecter

Configuration guidée pour Claude ? Configurer Ensembl avec Claude et les autres IA

Voyez tous les clients IA avec lesquels ce connector fonctionne ↑

Pour qui

Conçu pour le travail que les utilisateurs de Ensembl délèguent.

Ce connecteur est conçu pour les professionnels de la biologie et de l'analyse de données.

  • 01

    Bioinformaticiens

    Pour extraire rapidement des arbres de gènes et des données d'homologie sans coder en Python ou R.

  • 02

    Chercheurs en génomique

    Pour vérifier les versions d'identifiants stables et les symboles directement dans leur environnement de recherche.

  • 03

    Data Scientists

    Pour automatiser la récupération d'alignements génomiques et de métadonnées pour des analyses biologiques à grande échelle.

FAQ

Les questions des utilisateurs de Ensembl.

  • 01

    Do I need to write code to use this MCP?

    No. You interact with the Ensembl database using natural language through your AI client.

  • 02

    Can I use this with Claude or Cursor?

    Yes. This MCP is compatible with any MCP-enabled client, including Claude, Cursor, and Windsurf.

  • 03

    How do I access the public Ensembl data?

    When setting up your configuration, simply use 'PUBLIC' for standard access to the Ensembl REST API.

  • 04

    What kind of genomic sequences can I get?

    You can request sequences using specific stable identifiers or by defining a genomic region.

  • 05

    Does this support variant prediction?

    Yes. The MCP includes capabilities for bulk consequence prediction and specific HGVS notation queries.

  • 06

    How can I find orthologs for a specific gene across different species?

    Use the get_homology capability by providing the species name and the Ensembl gene ID. You can filter by type (e.g., 'orthologues') to see related genes in other organisms.

  • 07

    Can I retrieve the evolutionary gene tree for a specific identifier?

    Yes! The get_genetree capability allows you to fetch the gene tree for any stable Ensembl ID, with options for alignment and sequence types (protein or cdna).

  • 08

    How do I map a common gene symbol like 'BRCA2' to its Ensembl ID?

    Use the get_xrefs_symbol capability. Provide the species (e.g., 'human') and the symbol 'BRCA2' to retrieve all linked Ensembl objects and their stable identifiers.

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