- ターゲット
- 文献
- 関係性
- 検証
すぐに答え
遺伝子や薬を研究論文と結びつけるには?
このMCPを使用すると、AIが特定の遺伝子マーカーや化合物を特定し、それに対応するPubMedの生物医学論文を抽出します。分子ターゲットから関連文献まで、最短ルートでアクセス可能です。
研究のアウトプット
得られるデータ
AIは研究結果を以下の形式で整理します。
ターゲット
分子ターゲットの特定
AIが特定の遺伝子や薬の識別子を見つけ出します。研究にそのまま使える正確な名称やマーカーを取得できます。
文献
関連論文の抽出
AIが特定のPubMed論文を取得します。検索ワードに紐づく論文リストが手に入ります。
関係性
生物学的関連の可視化
化合物とその生物学的効果を紐付けます。論文内で薬が遺伝子とどのように相互作用しているかを把握できます。
検証
結果の確認
抽出された論文やデータをユーザー自身が確認します。AIは生の情報を提示しますが、科学的な妥当性の判断はユーザーが行います。
ワークフロー
研究クエリが届いた際のAIの動き
データベースの検索や情報の紐付けといった重い作業は、すべてAIが引き受けます。
ターゲットの特定
指定された遺伝子や化合物が正しい識別子であることを確認するため、AIが照合を行います。
search_genessearch_drugs文献の検索
ターゲットが特定されると、AIはその対象に言及している論文をPubMedから検索します。
get_related_articles結果の絞り込み
AIは、特定の研究目的に対して最も関連性の高い論文へと結果を絞り込みます。
get_related_articles結果の提示
AIは、抽出した論文リストと、ターゲットと研究内容の関連性を提示します。
get_related_articles
試してみる
以下のプロンプトをコピーして開始
これらのプロンプトを使って研究を始めましょう。
出発点
括弧内の用語を、実際に研究している特定の遺伝子、薬、またはトピックに書き換えてください。
PubMed / NCBI Connector
準備完了です。MCPクライアントを選択し、セットアップ手順に従ってください。
https://edge.vinkius.com/vk_preview_Er4T2DNOmXIPgLSBD4Sg49CsDjikKCAGM5l5oUWB/mcpClaude Desktop
以下の手順で数秒で接続できます。
- 1In Claude Desktop, open Settings → Connectors.
- 2Click “Add custom connector” and paste the connector link above as the remote MCP server URL.
- 3Click Add and start a new chat — PubMed / NCBI capabilities are ready to use.
{
"mcpServers": {
"stanford-pubmed-mcp": {
"url": "https://edge.vinkius.com/vk_preview_Er4T2DNOmXIPgLSBD4Sg49CsDjikKCAGM5l5oUWB/mcp"
}
}
}BRCA1遺伝子に関連するすべてのPubMed論文を見つけてください。
薬物メトホルミンと、それがグルコース代謝に及ぼす影響に関する研究を検索してください。
ACE2受容体と、最近のCOVID-19研究との関係を紐付けてください。
EGFR経路と相互作用する化合物を特定し、関連する論文を見つけてください。
Claude
ChatGPT
Cursor
VS Code
Windsurf
Claude Code
JetBrains
Cline
ここから始める
Stanford PubMedと一度接続すれば、すぐに質問できます。
リンクをクリックして接続してください。認証情報は暗号化されて保護されます。接続後は、お使いのクライアントですぐに質問を開始できます。
Stanford PubMedをAIに接続するFAQ
機能の詳細
- 01
AIは新しい研究論文を執筆できますか?
いいえ。AIはクエリに基づいてPubMedから既存の研究を見つけ出し、取得することのみを行います。
- 02
どの研究が重要かをAIが判断しますか?
AIは検索内容との関連性に基づいて論文を選択しますが、最終的な科学的妥当性の検証はユーザーが行う必要があります。
- 03
これを使ってタンパク質を検索できますか?
はい。遺伝子または薬の検索ツールを通じてそのタンパク質が特定できるのであれば、可能です。
- 04
AIはPubMedの記録を更新できますか?
いいえ。このMCPは読み取り専用です。データの検索と取得のみが可能で、外部データベースの内容を書き換えることはできません。
- 05
AIは新しい薬を提案しますか?
いいえ。研究データベースに既に存在する薬に関する情報を探すことしかできません。
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『PubMed / NCBI』を Claude、Cursor、ChatGPT などに接続
