EnsemblをChatGPT、Claude、Geminiに接続

• 01 / 03座標の変換方法
• 02 / 03オーソログ遺伝子の特定方法
• 03 / 03変異の影響を予測する方法

最速日

913ms

最遅日

1398ms

14日間の傾向

遅延傾向+16%

Ensembl Connector

準備完了です。MCPクライアントを選択し、セットアップ手順に従ってください。

コネクタリンクhttps://edge.vinkius.com/vk_preview_m0hayIErvjxLYR70lCwlpWpppEzV8unFkuPlELTW/mcpコピー

Claude Desktop

以下の手順で数秒で接続できます。

1. 1In Claude Desktop, open Settings → Connectors.
2. 2Click “Add custom connector” and paste the connector link above as the remote MCP server URL.
3. 3Click Add and start a new chat — Ensembl capabilities are ready to use.

設定 · claude_desktop_config.jsonコピー

{
  "mcpServers": {
    "ensembl-mcp": {
      "url": "https://edge.vinkius.com/vk_preview_m0hayIErvjxLYR70lCwlpWpppEzV8unFkuPlELTW/mcp"
    }
  }
}

• Claude
• ChatGPT
• Cursor
• VS Code
• Windsurf
• Claude Code
• JetBrains
• Cline

各クライアントの手順ガイドはこちらです。 接続方法

Claude向けのガイド付きセットアップ？ EnsemblをClaudeや他のAIに設定する

このConnectorが対応するすべてのAIクライアントを見る ↑

• 01

  バイオインフォマティシャン

  PythonやRのカスタムスクリプトを書くことなく、遺伝子ツリーや相同性データを迅速に取得できます。

• 02

  ゲノム研究者

  研究環境から直接、安定したIDのバージョン確認やシンボルの相互参照を行えます。

• 03

  データサイエンティスト

  大規模な生物学的解析のために、ゲノムアライメントやメタデータの取得を自動化できます。

• 01

  Do I need to write code to use this MCP?

  No. You interact with the Ensembl database using natural language through your AI client.

• 02

  Can I use this with Claude or Cursor?

  Yes. This MCP is compatible with any MCP-enabled client, including Claude, Cursor, and Windsurf.

• 03

  How do I access the public Ensembl data?

  When setting up your configuration, simply use 'PUBLIC' for standard access to the Ensembl REST API.

• 04

  What kind of genomic sequences can I get?

  You can request sequences using specific stable identifiers or by defining a genomic region.

• 05

  Does this support variant prediction?

  Yes. The MCP includes capabilities for bulk consequence prediction and specific HGVS notation queries.

• 06

  How can I find orthologs for a specific gene across different species?

  Use the get_homology capability by providing the species name and the Ensembl gene ID. You can filter by type (e.g., 'orthologues') to see related genes in other organisms.

• 07

  Can I retrieve the evolutionary gene tree for a specific identifier?

  Yes! The get_genetree capability allows you to fetch the gene tree for any stable Ensembl ID, with options for alignment and sequence types (protein or cdna).

• 08

  How do I map a common gene symbol like 'BRCA2' to its Ensembl ID?

  Use the get_xrefs_symbol capability. Provide the species (e.g., 'human') and the symbol 'BRCA2' to retrieve all linked Ensembl objects and their stable identifiers.

• 

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